圣彼得堡国立水上交通大学建于1809年，当时学校的名称是列宁格勒水上运输学院。圣彼得堡国立水上交通大学是一所专门培养水运人才的高等教育机构。学校下设有：船舶机械系、船舶驾驶系、水文技术系、码头技术管理系、机电学系、区域及远程教育系、经济与财政系、信息技术系、法律系、人文系、函授系。同时开设有本科、硕士、博士专业40多个，如：船舶动力系统、水资源的综合利用与保护、港口码头运输与机械装卸、水运及管理、造船学、船舶动力系统操作、导航学、水运交通管理学、工业自动化设备与电源配合、信息系统与技术、水利工程建设、水路与水文、水路运输与航行维护、自动化信息安全、危机应对管理、文化学、广告学、旅游、金融与信贷、企业经济管理、历史学、教育学、法学等。